Этот вуз был создан путем слияния БашГУ и УГАТУ при поддержке главы республики Радия Хабирова. Окончательное решение о слиянии вузов было принято 24 декабря 2021 года в министерстве образования и науки РФ.
Исполняющим обязанности ректора нового вуза назначен Вадим Захаров. Он сообщил журналистам «Башинформа», что по количеству студентов вуз будет входить в первую пятерку вузов России. С этого года выпускники вуза получат дипломы с надписью: поступил в БашГУ или УГАТУ, закончил – Уфимский институт науки и технологий.
Теперь новый учреждение войдет в программу поддержки вузов «Приоритет 2030» и ежегодно будет получать грант в размере 100 млн рублей. К 20230 году Уфимский университет науки и технологий должен войти в число 30 лучших вузов России.